{"id":583,"date":"2026-07-22T08:17:33","date_gmt":"2026-07-22T08:17:33","guid":{"rendered":"https:\/\/matforge.org\/?p=583","raw":"https:\/\/matforge.org\/?p=583"},"modified":"2026-07-22T08:17:33","modified_gmt":"2026-07-22T08:17:33","slug":"best-practices-for-maintaining-scientific-code","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/matforge.org\/es\/best-practices-for-maintaining-scientific-code\/","title":{"rendered":"Mejores pr\u00e1cticas para mantener el c\u00f3digo cient\u00edfico","raw":"Mejores pr\u00e1cticas para mantener el c\u00f3digo cient\u00edfico"},"content":{"rendered":"<span class=\"span-reading-time rt-reading-time\" style=\"display: block;\"><span class=\"rt-label rt-prefix\">Reading Time: <\/span> <span class=\"rt-time\"> 9<\/span> <span class=\"rt-label rt-postfix\">minutes<\/span><\/span><p>El c\u00f3digo cient\u00edfico a menudo comienza como un gui\u00f3n r\u00e1pido. Un investigador necesita limpiar un conjunto de datos, ejecutar una simulaci\u00f3n, probar un modelo, generar una figura o verificar una hip\u00f3tesis. Al principio, el c\u00f3digo puede ser escrito para una persona y una tarea inmediata. Pero con el tiempo, ese mismo script puede convertirse en parte de un documento publicado, una disertaci\u00f3n, un flujo de trabajo de laboratorio, un proyecto de c\u00f3digo abierto o un modelo computacional a largo plazo.<\/p>\n<p>Cuando el c\u00f3digo influye en los resultados cient\u00edficos, se convierte en parte de la investigaci\u00f3n misma. Debe ser comprensible, reproducible, comprobable y seguro de modificar. El c\u00f3digo mal mantenido puede hacer que los resultados sean dif\u00edciles de verificar, ralentizar el trabajo futuro e introducir errores que son dif\u00edciles de detectar.<\/p>\n<p>Mantener el c\u00f3digo cient\u00edfico no significa convertir cada gui\u00f3n de investigaci\u00f3n en un gran producto de software comercial. Significa usar suficiente estructura y disciplina para que el c\u00f3digo pueda ser confiado por su futuro yo, colaboradores, revisores y cualquier persona que necesite construir sobre el trabajo m\u00e1s adelante.<\/p>\n<h2>Por qu\u00e9 el c\u00f3digo cient\u00edfico necesita mantenimiento<\/h2>\n<p>El c\u00f3digo cient\u00edfico a menudo vive m\u00e1s de lo esperado. Se puede reutilizar un peque\u00f1o script de an\u00e1lisis para un segundo conjunto de datos. Una simulaci\u00f3n puede convertirse en la base de un art\u00edculo. Un cuaderno se puede compartir con un colaborador. Un modelo puede ser extendido por un futuro estudiante en el mismo laboratorio.<\/p>\n<p>Esto crea un problema. El c\u00f3digo que fue claro durante la semana en que se escribi\u00f3 puede volverse confuso meses despu\u00e9s. Las rutas de archivo pueden romperse. Las versiones de la biblioteca pueden cambiar. Los par\u00e1metros pueden ser olvidados. Los pasos de limpieza de datos pueden no estar claros. Una figura puede ser imposible de recrear porque nadie recuerda qu\u00e9 gui\u00f3n la produjo.<\/p>\n<p>El mantenimiento ayuda a prevenir estos problemas. Protege la confiabilidad del proceso de investigaci\u00f3n al hacer que el c\u00f3digo sea m\u00e1s f\u00e1cil de inspeccionar, volver a ejecutar, probar y actualizar. En la investigaci\u00f3n computacional, esto no es una burocracia extra. Es parte de la calidad de la investigaci\u00f3n.<\/p>\n<h2>Escriba el c\u00f3digo para su futuro yo primero<\/h2>\n<p>La primera persona que se beneficia de un c\u00f3digo cient\u00edfico limpio suele ser el autor. Despu\u00e9s de unos meses lejos de un proyecto, incluso su propio c\u00f3digo puede parecer desconocido. Una buena denominaci\u00f3n, estructura y comentarios te ayudan a volver al trabajo sin comenzar desde cero.<\/p>\n<p>Use nombres de variables y funciones que expliquen lo que representan. Un nombre como <strong>temperature_kelvin<\/strong> es m\u00e1s \u00fatil que <strong>temp2<\/strong>. Una funci\u00f3n llamada <strong>calculate_growth_rate<\/strong> es m\u00e1s f\u00e1cil de entender que una llamada <strong>process_data<\/strong>.<\/p>\n<p>Divida scripts largos en funciones m\u00e1s peque\u00f1as. Un solo script que carga datos, los limpia, ejecuta un modelo, genera gr\u00e1ficos y guarda resultados es dif\u00edcil de depurar. Las funciones m\u00e1s peque\u00f1as hacen que el flujo de trabajo sea m\u00e1s f\u00e1cil de probar y reutilizar.<\/p>\n<p>Los comentarios deben explicar las decisiones, no repetir el c\u00f3digo obvio. Un comentario es m\u00e1s \u00fatil cuando explica por qu\u00e9 se eligi\u00f3 un m\u00e9todo, umbral, suposici\u00f3n o par\u00e1metro.<\/p>\n<h2>Mantener una estructura de proyecto clara<\/h2>\n<p>Los proyectos cient\u00edficos pueden ensuciarse r\u00e1pidamente si los scripts, los datos sin procesar, los datos procesados, los cuadernos, las figuras y los resultados se encuentran en una sola carpeta. Una estructura clara hace que el proyecto sea m\u00e1s f\u00e1cil de navegar y reduce la posibilidad de usar un archivo incorrecto.<\/p>\n<pre><code>project-name\/\n  README.md\n  data\/\n    raw\/\n    processed\/\n  src\/\n  notebooks\/\n  scripts\/\n  results\/\n  figures\/\n  tests\/\n  docs\/\n  environment.yml\n<\/code><\/pre>\n<p>La estructura exacta puede variar, pero la l\u00f3gica deber\u00eda ser clara. Los datos sin procesar deben separarse de los datos procesados. El c\u00f3digo fuente estable debe separarse de los cuadernos exploratorios. Los resultados y las cifras deber\u00edan ser f\u00e1ciles de rastrear hasta el c\u00f3digo que las gener\u00f3.<\/p>\n<p>La carpeta <strong>data\/raw<\/strong> debe contener datos originales que no se editan manualmente. La carpeta <strong>datos\/procesados<\/strong> puede contener datos limpios o transformados. La carpeta <strong>src<\/strong> debe contener c\u00f3digo reutilizable. La carpeta <strong>Notebooks<\/strong> se puede utilizar para la exploraci\u00f3n. La carpeta <strong>pruebas<\/strong> debe contener comprobaciones que confirmen que el c\u00f3digo importante a\u00fan funciona.<\/p>\n<h2>Usar el control de versiones desde el principio<\/h2>\n<p>El control de versiones ayuda a rastrear c\u00f3mo cambia el c\u00f3digo con el tiempo. Git es la herramienta m\u00e1s com\u00fan, pero el principio importa m\u00e1s que la plataforma espec\u00edfica: deber\u00edas poder ver qu\u00e9 cambi\u00f3, cu\u00e1ndo cambi\u00f3 y por qu\u00e9.<\/p>\n<p>Sin control de versiones, los investigadores a menudo crean archivos con nombres como <strong>AN\u00c1LISIS_FINAL<\/strong>, <strong>AN\u00c1LISIS_FINAL2<\/strong>, <strong>AN\u00c1LISIS_NEW<\/strong> o <strong>ANALYSIS_REALALLY_FINAL<\/strong>. Esto r\u00e1pidamente se vuelve confuso y poco confiable.<\/p>\n<p>Los buenos h\u00e1bitos de control de versiones incluyen realizar peque\u00f1as confirmaciones l\u00f3gicas, escribir mensajes de confirmaci\u00f3n significativos, usar ramas para experimentos y etiquetar la versi\u00f3n de c\u00f3digo utilizada para un art\u00edculo o informe.<\/p>\n<p>Tenga cuidado con grandes conjuntos de datos e informaci\u00f3n confidencial. No todo pertenece a un repositorio de Git. Los archivos grandes, los datos privados, las credenciales y los materiales de investigaci\u00f3n restringidos deben manejarse a trav\u00e9s de sistemas de almacenamiento y controles de acceso apropiados.<\/p>\n<h2>Documente el prop\u00f3sito, las entradas y las salidas<\/h2>\n<p>La documentaci\u00f3n no necesita ser larga para ser \u00fatil. Como m\u00ednimo, deber\u00eda responder algunas preguntas pr\u00e1cticas: \u00bfQu\u00e9 hace este c\u00f3digo, qu\u00e9 datos necesita, c\u00f3mo lo ejecuta y qu\u00e9 salida debe producir?<\/p>\n<p>Un buen L\u00e9ame es el punto de entrada a un proyecto de c\u00f3digo cient\u00edfico. Debe explicar el prop\u00f3sito del proyecto, los pasos de instalaci\u00f3n, las dependencias, el uso b\u00e1sico, la preparaci\u00f3n de datos, los resultados esperados y la informaci\u00f3n de contacto o mantenedor.<\/p>\n<p>Si el c\u00f3digo admite una publicaci\u00f3n o un conjunto de datos p\u00fablico, el L\u00e9ame tambi\u00e9n debe explicar c\u00f3mo citar el trabajo y qu\u00e9 versi\u00f3n del c\u00f3digo produjo los resultados publicados.<\/p>\n<p>La documentaci\u00f3n debe escribirse gradualmente. Si espera hasta el final del proyecto, es posible que ya se olviden muchos detalles. Algunas notas escritas durante el desarrollo pueden ahorrar horas despu\u00e9s.<\/p>\n<h2>Configuraci\u00f3n separada del c\u00f3digo<\/h2>\n<p>El c\u00f3digo cient\u00edfico a menudo depende de los par\u00e1metros: rutas de archivo, configuraci\u00f3n del modelo, umbrales, semillas aleatorias, carpetas de salida, versiones de conjuntos de datos y opciones de experimentos. Si estos valores est\u00e1n ocultos dentro de los scripts, el flujo de trabajo se vuelve fr\u00e1gil.<\/p>\n<p>Las rutas codificadas son especialmente comunes. Un script puede funcionar solo en la computadora port\u00e1til de una persona porque apunta a una carpeta local. Cuando otra persona lo ejecuta, el script falla inmediatamente.<\/p>\n<p>Un mejor enfoque es separar la configuraci\u00f3n del c\u00f3digo. Utilice archivos de configuraci\u00f3n, argumentos de l\u00ednea de comandos, variables de entorno o archivos de par\u00e1metros claramente nombrados. Esto hace que los experimentos sean m\u00e1s f\u00e1ciles de volver a ejecutar y comparar.<\/p>\n<p>Cuando los par\u00e1metros son visibles, el proceso de investigaci\u00f3n se vuelve m\u00e1s transparente. Alguien que revise el trabajo puede ver qu\u00e9 configuraciones se utilizaron en lugar de buscar a trav\u00e9s de scripts largos.<\/p>\n<h2>hacer que el entorno computacional sea reproducible<\/h2>\n<p>El c\u00f3digo cient\u00edfico no se ejecuta de forma aislada. Depende de los lenguajes de programaci\u00f3n, bibliotecas, compiladores, sistemas operativos y, a veces, hardware. Un gui\u00f3n que funciona hoy puede fallar el pr\u00f3ximo a\u00f1o porque cambi\u00f3 una biblioteca.<\/p>\n<p>Para reducir este riesgo, documente el entorno computacional. Dependiendo del idioma y el proyecto, esto puede incluir <strong>requirements.txt<\/strong>, <strong>environment.yml<\/strong>, archivos de bloqueo, entornos virtuales, contenedores o versiones documentadas del compilador.<\/p>\n<p>El objetivo es evitar el problema de \u00abfunciona en mi m\u00e1quina\u00bb. Un colaborador deber\u00eda poder configurar un entorno similar y ejecutar el c\u00f3digo sin adivinar qu\u00e9 versiones de paquetes se utilizaron.<\/p>\n<p>Para trabajos publicados importantes, considere archivar la versi\u00f3n exacta del c\u00f3digo y la informaci\u00f3n del entorno utilizada para producir los resultados.<\/p>\n<h2>Pruebe la l\u00f3gica cient\u00edfica cr\u00edtica<\/h2>\n<p>Las pruebas no son s\u00f3lo para software comercial. El c\u00f3digo cient\u00edfico puede ejecutarse sin errores y a\u00fan as\u00ed producir resultados err\u00f3neos. Las pruebas ayudan a detectar errores antes de que afecten las conclusiones.<\/p>\n<p>No todas las partes de un proyecto de investigaci\u00f3n necesitan pruebas exhaustivas, pero se debe verificar la l\u00f3gica cr\u00edtica. Esto incluye funciones de limpieza de datos, rutinas num\u00e9ricas, conversiones de unidades, condiciones de contorno, c\u00e1lculos estad\u00edsticos y salidas de simulaci\u00f3n.<\/p>\n<table class=\"custom-table\">\n<tbody>\n<tr>\n<th>Tipo de prueba<\/th>\n<th>lo que protege<\/th>\n<th>Ejemplo<\/th>\n<\/tr>\n<tr>\n<td>Prueba de unidad<\/td>\n<td>Comportamiento de funci\u00f3n peque\u00f1a<\/td>\n<td>Una funci\u00f3n de normalizaci\u00f3n devuelve los valores esperados.<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td>Prueba de regresi\u00f3n<\/td>\n<td>Resultados verificados previamente<\/td>\n<td>Una simulaci\u00f3n todav\u00eda produce la misma salida de referencia.<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td>Prueba de validaci\u00f3n de datos<\/td>\n<td>Supuestos de entrada<\/td>\n<td>No aparecen valores negativos en un campo que debe ser positivo.<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td>Prueba de integraci\u00f3n<\/td>\n<td>Comportamiento completo del flujo de trabajo<\/td>\n<td>La canalizaci\u00f3n se ejecuta desde los datos de entrada hasta la salida final.<\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n<p>Las pruebas son especialmente \u00fatiles cuando cambia el c\u00f3digo. Un peque\u00f1o refactor puede alterar accidentalmente los resultados. Una prueba de regresi\u00f3n puede advertirle cuando un cambio afecta a la salida en la que se confiaba previamente.<\/p>\n<h2>Tratar los datos como parte del flujo de trabajo de base de c\u00f3digo<\/h2>\n<p>El c\u00f3digo cient\u00edfico generalmente depende en gran medida de los datos. Si el flujo de trabajo de datos no est\u00e1 claro, los resultados son dif\u00edciles de reproducir incluso cuando el c\u00f3digo est\u00e1 disponible.<\/p>\n<p>Los datos sin procesar deben conservarse siempre que sea posible. No edite manualmente los archivos originales sin registrar lo que cambi\u00f3. Si los datos deben limpiarse o transformarse, documente los pasos y conserve el c\u00f3digo de procesamiento.<\/p>\n<p>Seguimiento de versiones de conjuntos de datos. Registre de d\u00f3nde provienen los datos, cu\u00e1ndo se descarg\u00f3 o se recopil\u00f3, qu\u00e9 exclusiones se aplicaron, c\u00f3mo se manejaron los valores faltantes y qu\u00e9 archivo procesado se utiliz\u00f3 para cada resultado.<\/p>\n<p>Para archivos importantes, las sumas de verificaci\u00f3n o los manifiestos pueden ayudar a confirmar que los datos no han cambiado de forma inesperada. Esto es especialmente \u00fatil cuando se trabaja con grandes conjuntos de datos, almacenamiento compartido o proyectos de larga duraci\u00f3n.<\/p>\n<h2>Evite las canalizaciones de investigaci\u00f3n solo para port\u00e1tiles<\/h2>\n<p>Los cuadernos son \u00fatiles para la exploraci\u00f3n, visualizaci\u00f3n y explicaci\u00f3n. Permiten a los investigadores combinar c\u00f3digo, texto, tramas y resultados en un solo lugar. Pero los cuadernos pueden ser dif\u00edciles de mantener cuando realizan toda la tuber\u00eda de investigaci\u00f3n.<\/p>\n<p>Los problemas comunes de cuaderno incluyen celdas que se quedan sin orden, estado oculto, dependencias poco claras, c\u00f3digo repetido, an\u00e1lisis mixto y l\u00f3gica de producci\u00f3n, y funciones de prueba de dificultad.<\/p>\n<p>Un mejor enfoque es utilizar cuadernos para la exploraci\u00f3n y la comunicaci\u00f3n, mientras se mueven funciones estables a archivos fuente reutilizables. Los cuadernos deben llamar c\u00f3digo probado en lugar de contener toda la l\u00f3gica importante.<\/p>\n<p>Antes de compartir o archivar un cuaderno, rein\u00edcielo y ejecute todas las celdas de arriba a abajo. Esto ayuda a confirmar que el cuaderno no depende del estado oculto de experimentos anteriores.<\/p>\n<h2>Use revisiones de c\u00f3digo o verificaciones de pares cuando sea posible<\/h2>\n<p>El c\u00f3digo cient\u00edfico se beneficia de la revisi\u00f3n. Una segunda persona puede notar suposiciones poco claras, unidades incorrectas, caminos fr\u00e1giles, falta de validaci\u00f3n, nombres confusos o l\u00f3gica duplicada que el autor puede pasar por alto.<\/p>\n<p>La revisi\u00f3n del c\u00f3digo en la investigaci\u00f3n no necesita ser formal o intimidante. Incluso una breve verificaci\u00f3n de pares puede mejorar la confiabilidad. Un colaborador puede revisar una funci\u00f3n de limpieza de datos, una implementaci\u00f3n de modelo, un c\u00e1lculo estad\u00edstico o el script que genera cifras finales.<\/p>\n<p>El objetivo no es la cr\u00edtica. El objetivo es proteger la investigaci\u00f3n de errores evitables. El trabajo cient\u00edfico se vuelve m\u00e1s fuerte cuando el c\u00f3digo importante es m\u00e1s f\u00e1cil de inspeccionar para otra persona.<\/p>\n<h2>Registre los experimentos y los resultados con claridad<\/h2>\n<p>Los proyectos cient\u00edficos a menudo involucran muchas ejecuciones con diferentes par\u00e1metros, conjuntos de datos, semillas aleatorias o configuraciones de modelos. Sin un registro claro, se vuelve dif\u00edcil saber qu\u00e9 ejecuci\u00f3n produjo qu\u00e9 resultado.<\/p>\n<p>Los registros de experimentos \u00fatiles pueden incluir:<\/p>\n<ul>\n<li>Fecha y hora<\/li>\n<li>Versi\u00f3n de c\u00f3digo<\/li>\n<li>Versi\u00f3n del conjunto de datos<\/li>\n<li>par\u00e1metros<\/li>\n<li>semilla al azar<\/li>\n<li>Entorno de software<\/li>\n<li>Lugar de salida<\/li>\n<li>Estado de \u00e9xito o fracaso<\/li>\n<li>Notas cortas sobre cambios<\/li>\n<\/ul>\n<p>Las semillas aleatorias son especialmente importantes en simulaciones, aprendizaje autom\u00e1tico, muestreo y modelos estoc\u00e1sticos. Registrarlos ayuda a que los resultados sean m\u00e1s f\u00e1ciles de reproducir y depurar.<\/p>\n<h2>Manejar errores y casos de borde expl\u00edcitamente<\/h2>\n<p>En la inform\u00e1tica cient\u00edfica, las fallas silenciosas pueden ser peores que los errores visibles. Un script que se bloquea claramente es m\u00e1s f\u00e1cil de arreglar que un script que produce resultados incorrectos en silencio.<\/p>\n<p>Valide las entradas antes de ejecutar los c\u00e1lculos principales. Verifique las unidades, rangos, dimensiones, valores faltantes, existencia de archivos y suposiciones sobre los datos. Si una suposici\u00f3n cr\u00edtica falla, la tuber\u00eda deber\u00eda detenerse o advertir claramente.<\/p>\n<p>Los mensajes de error deben ser significativos. Un mensaje como <strong>Falta el archivo de entrada: Data\/Procesed\/Clean_Sample.csv<\/strong> esperado es mucho m\u00e1s \u00fatil que un bloqueo gen\u00e9rico.<\/p>\n<p>Un buen manejo de errores protege la integridad de la investigaci\u00f3n porque evita que las suposiciones incorrectas se desplacen silenciosamente hacia los resultados finales.<\/p>\n<h2>Plan de entrega y uso a largo plazo<\/h2>\n<p>El c\u00f3digo cient\u00edfico a menudo sobrevive a la persona que lo escribi\u00f3. un estudiante se grad\u00faa. Un postdoctorado se va. Un colaborador se une m\u00e1s tarde. Un laboratorio quiere reutilizar una canalizaci\u00f3n para un nuevo proyecto. La planificaci\u00f3n para el traspaso hace que esta transici\u00f3n sea m\u00e1s f\u00e1cil.<\/p>\n<p>Un proyecto mantenible debe incluir una gu\u00eda de configuraci\u00f3n, entrada y salida de ejemplo, limitaciones conocidas, descripci\u00f3n del flujo de trabajo, seguimiento de problemas, licencia, informaci\u00f3n de citas y versi\u00f3n archivada para el trabajo publicado.<\/p>\n<p>Tambi\u00e9n es \u00fatil incluir una breve explicaci\u00f3n de lo que el c\u00f3digo no hace. Las limitaciones forman parte de la documentaci\u00f3n responsable. Ayudan a los futuros usuarios a evitar aplicar el c\u00f3digo de manera que no fue dise\u00f1ado.<\/p>\n<h2>Errores comunes a evitar<\/h2>\n<h3>Mantener todo en un gui\u00f3n<\/h3>\n<p>Un script grande puede ser r\u00e1pido de escribir, pero se vuelve dif\u00edcil de leer, probar, depurar y reutilizar. Divida la l\u00f3gica estable en funciones y m\u00f3dulos.<\/p>\n<h3>Cambiar datos manualmente sin grabarlos<\/h3>\n<p>Las ediciones manuales dificultan la reproducibilidad. Si los datos cambian, el cambio debe documentarse o realizarse a trav\u00e9s de un script.<\/p>\n<h3>Dependiendo de las versiones de software no especificadas<\/h3>\n<p>Si no se registran las dependencias, otro usuario puede instalar versiones m\u00e1s recientes y obtener resultados o errores diferentes.<\/p>\n<h3>Tratar las pruebas como innecesarias<\/h3>\n<p>El c\u00f3digo cient\u00edfico puede contener errores graves incluso cuando se ejecuta con \u00e9xito. Las pruebas protegen los c\u00e1lculos y los flujos de trabajo cr\u00edticos.<\/p>\n<h3>Documentando solo al final<\/h3>\n<p>Los detalles importantes a menudo se olvidan al final de un proyecto. Documente las suposiciones, los par\u00e1metros y las decisiones del flujo de trabajo a medida que se desarrolla el proyecto.<\/p>\n<h2>Pensamientos finales: el c\u00f3digo mantenible hace que la ciencia sea m\u00e1s f\u00e1cil de confiar<\/h2>\n<p>Mantener el c\u00f3digo cient\u00edfico no se trata de hacer que la investigaci\u00f3n sea m\u00e1s lenta. Se trata de hacer que la investigaci\u00f3n sea m\u00e1s f\u00e1cil de entender, repetir, verificar y extender. Un proyecto con estructura clara, control de versiones, documentaci\u00f3n, pruebas, entornos reproducibles y un cuidadoso manejo de datos es m\u00e1s confiable que uno mantenido unido por la memoria y los archivos dispersos.<\/p>\n<p>Las buenas pr\u00e1cticas de mantenimiento no necesitan ser excesivas. Comience con lo b\u00e1sico: nombres claros, carpetas organizadas, un archivo L\u00e9ame, control de versiones, dependencias registradas, pruebas simples y pasos de datos documentados. Estos h\u00e1bitos crean una base que protege tanto el software como la investigaci\u00f3n construida sobre \u00e9l.<\/p>\n<p>El c\u00f3digo cient\u00edfico es parte de la evidencia detr\u00e1s de las afirmaciones cient\u00edficas. Cuando se mantiene bien, los resultados se vuelven m\u00e1s f\u00e1ciles de confiar y el trabajo futuro se vuelve m\u00e1s f\u00e1cil de construir.<\/p>\n","protected":false,"raw":"<p>El c\u00f3digo cient\u00edfico a menudo comienza como un gui\u00f3n r\u00e1pido. Un investigador necesita limpiar un conjunto de datos, ejecutar una simulaci\u00f3n, probar un modelo, generar una figura o verificar una hip\u00f3tesis. Al principio, el c\u00f3digo puede ser escrito para una persona y una tarea inmediata. Pero con el tiempo, ese mismo script puede convertirse en parte de un documento publicado, una disertaci\u00f3n, un flujo de trabajo de laboratorio, un proyecto de c\u00f3digo abierto o un modelo computacional a largo plazo.<\/p>\n<p>Cuando el c\u00f3digo influye en los resultados cient\u00edficos, se convierte en parte de la investigaci\u00f3n misma. Debe ser comprensible, reproducible, comprobable y seguro de modificar. El c\u00f3digo mal mantenido puede hacer que los resultados sean dif\u00edciles de verificar, ralentizar el trabajo futuro e introducir errores que son dif\u00edciles de detectar.<\/p>\n<p>Mantener el c\u00f3digo cient\u00edfico no significa convertir cada gui\u00f3n de investigaci\u00f3n en un gran producto de software comercial. Significa usar suficiente estructura y disciplina para que el c\u00f3digo pueda ser confiado por su futuro yo, colaboradores, revisores y cualquier persona que necesite construir sobre el trabajo m\u00e1s adelante.<\/p>\n<h2>Por qu\u00e9 el c\u00f3digo cient\u00edfico necesita mantenimiento<\/h2>\n<p>El c\u00f3digo cient\u00edfico a menudo vive m\u00e1s de lo esperado. Se puede reutilizar un peque\u00f1o script de an\u00e1lisis para un segundo conjunto de datos. Una simulaci\u00f3n puede convertirse en la base de un art\u00edculo. Un cuaderno se puede compartir con un colaborador. Un modelo puede ser extendido por un futuro estudiante en el mismo laboratorio.<\/p>\n<p>Esto crea un problema. El c\u00f3digo que fue claro durante la semana en que se escribi\u00f3 puede volverse confuso meses despu\u00e9s. Las rutas de archivo pueden romperse. Las versiones de la biblioteca pueden cambiar. Los par\u00e1metros pueden ser olvidados. Los pasos de limpieza de datos pueden no estar claros. Una figura puede ser imposible de recrear porque nadie recuerda qu\u00e9 gui\u00f3n la produjo.<\/p>\n<p>El mantenimiento ayuda a prevenir estos problemas. Protege la confiabilidad del proceso de investigaci\u00f3n al hacer que el c\u00f3digo sea m\u00e1s f\u00e1cil de inspeccionar, volver a ejecutar, probar y actualizar. En la investigaci\u00f3n computacional, esto no es una burocracia extra. Es parte de la calidad de la investigaci\u00f3n.<\/p>\n<h2>Escriba el c\u00f3digo para su futuro yo primero<\/h2>\n<p>La primera persona que se beneficia de un c\u00f3digo cient\u00edfico limpio suele ser el autor. Despu\u00e9s de unos meses lejos de un proyecto, incluso su propio c\u00f3digo puede parecer desconocido. Una buena denominaci\u00f3n, estructura y comentarios te ayudan a volver al trabajo sin comenzar desde cero.<\/p>\n<p>Use nombres de variables y funciones que expliquen lo que representan. Un nombre como <strong>temperature_kelvin<\/strong> es m\u00e1s \u00fatil que <strong>temp2<\/strong>. Una funci\u00f3n llamada <strong>calculate_growth_rate<\/strong> es m\u00e1s f\u00e1cil de entender que una llamada <strong>process_data<\/strong>.<\/p>\n<p>Divida scripts largos en funciones m\u00e1s peque\u00f1as. Un solo script que carga datos, los limpia, ejecuta un modelo, genera gr\u00e1ficos y guarda resultados es dif\u00edcil de depurar. Las funciones m\u00e1s peque\u00f1as hacen que el flujo de trabajo sea m\u00e1s f\u00e1cil de probar y reutilizar.<\/p>\n<p>Los comentarios deben explicar las decisiones, no repetir el c\u00f3digo obvio. Un comentario es m\u00e1s \u00fatil cuando explica por qu\u00e9 se eligi\u00f3 un m\u00e9todo, umbral, suposici\u00f3n o par\u00e1metro.<\/p>\n<h2>Mantener una estructura de proyecto clara<\/h2>\n<p>Los proyectos cient\u00edficos pueden ensuciarse r\u00e1pidamente si los scripts, los datos sin procesar, los datos procesados, los cuadernos, las figuras y los resultados se encuentran en una sola carpeta. Una estructura clara hace que el proyecto sea m\u00e1s f\u00e1cil de navegar y reduce la posibilidad de usar un archivo incorrecto.<\/p>\n<pre><code>project-name\/\n  README.md\n  data\/\n    raw\/\n    processed\/\n  src\/\n  notebooks\/\n  scripts\/\n  results\/\n  figures\/\n  tests\/\n  docs\/\n  environment.yml\n<\/code><\/pre>\n<p>La estructura exacta puede variar, pero la l\u00f3gica deber\u00eda ser clara. Los datos sin procesar deben separarse de los datos procesados. El c\u00f3digo fuente estable debe separarse de los cuadernos exploratorios. Los resultados y las cifras deber\u00edan ser f\u00e1ciles de rastrear hasta el c\u00f3digo que las gener\u00f3.<\/p>\n<p>La carpeta <strong>data\/raw<\/strong> debe contener datos originales que no se editan manualmente. La carpeta <strong>datos\/procesados<\/strong> puede contener datos limpios o transformados. La carpeta <strong>src<\/strong> debe contener c\u00f3digo reutilizable. La carpeta <strong>Notebooks<\/strong> se puede utilizar para la exploraci\u00f3n. La carpeta <strong>pruebas<\/strong> debe contener comprobaciones que confirmen que el c\u00f3digo importante a\u00fan funciona.<\/p>\n<h2>Usar el control de versiones desde el principio<\/h2>\n<p>El control de versiones ayuda a rastrear c\u00f3mo cambia el c\u00f3digo con el tiempo. Git es la herramienta m\u00e1s com\u00fan, pero el principio importa m\u00e1s que la plataforma espec\u00edfica: deber\u00edas poder ver qu\u00e9 cambi\u00f3, cu\u00e1ndo cambi\u00f3 y por qu\u00e9.<\/p>\n<p>Sin control de versiones, los investigadores a menudo crean archivos con nombres como <strong>AN\u00c1LISIS_FINAL<\/strong>, <strong>AN\u00c1LISIS_FINAL2<\/strong>, <strong>AN\u00c1LISIS_NEW<\/strong> o <strong>ANALYSIS_REALALLY_FINAL<\/strong>. Esto r\u00e1pidamente se vuelve confuso y poco confiable.<\/p>\n<p>Los buenos h\u00e1bitos de control de versiones incluyen realizar peque\u00f1as confirmaciones l\u00f3gicas, escribir mensajes de confirmaci\u00f3n significativos, usar ramas para experimentos y etiquetar la versi\u00f3n de c\u00f3digo utilizada para un art\u00edculo o informe.<\/p>\n<p>Tenga cuidado con grandes conjuntos de datos e informaci\u00f3n confidencial. No todo pertenece a un repositorio de Git. Los archivos grandes, los datos privados, las credenciales y los materiales de investigaci\u00f3n restringidos deben manejarse a trav\u00e9s de sistemas de almacenamiento y controles de acceso apropiados.<\/p>\n<h2>Documente el prop\u00f3sito, las entradas y las salidas<\/h2>\n<p>La documentaci\u00f3n no necesita ser larga para ser \u00fatil. Como m\u00ednimo, deber\u00eda responder algunas preguntas pr\u00e1cticas: \u00bfQu\u00e9 hace este c\u00f3digo, qu\u00e9 datos necesita, c\u00f3mo lo ejecuta y qu\u00e9 salida debe producir?<\/p>\n<p>Un buen L\u00e9ame es el punto de entrada a un proyecto de c\u00f3digo cient\u00edfico. Debe explicar el prop\u00f3sito del proyecto, los pasos de instalaci\u00f3n, las dependencias, el uso b\u00e1sico, la preparaci\u00f3n de datos, los resultados esperados y la informaci\u00f3n de contacto o mantenedor.<\/p>\n<p>Si el c\u00f3digo admite una publicaci\u00f3n o un conjunto de datos p\u00fablico, el L\u00e9ame tambi\u00e9n debe explicar c\u00f3mo citar el trabajo y qu\u00e9 versi\u00f3n del c\u00f3digo produjo los resultados publicados.<\/p>\n<p>La documentaci\u00f3n debe escribirse gradualmente. Si espera hasta el final del proyecto, es posible que ya se olviden muchos detalles. Algunas notas escritas durante el desarrollo pueden ahorrar horas despu\u00e9s.<\/p>\n<h2>Configuraci\u00f3n separada del c\u00f3digo<\/h2>\n<p>El c\u00f3digo cient\u00edfico a menudo depende de los par\u00e1metros: rutas de archivo, configuraci\u00f3n del modelo, umbrales, semillas aleatorias, carpetas de salida, versiones de conjuntos de datos y opciones de experimentos. Si estos valores est\u00e1n ocultos dentro de los scripts, el flujo de trabajo se vuelve fr\u00e1gil.<\/p>\n<p>Las rutas codificadas son especialmente comunes. Un script puede funcionar solo en la computadora port\u00e1til de una persona porque apunta a una carpeta local. Cuando otra persona lo ejecuta, el script falla inmediatamente.<\/p>\n<p>Un mejor enfoque es separar la configuraci\u00f3n del c\u00f3digo. Utilice archivos de configuraci\u00f3n, argumentos de l\u00ednea de comandos, variables de entorno o archivos de par\u00e1metros claramente nombrados. Esto hace que los experimentos sean m\u00e1s f\u00e1ciles de volver a ejecutar y comparar.<\/p>\n<p>Cuando los par\u00e1metros son visibles, el proceso de investigaci\u00f3n se vuelve m\u00e1s transparente. Alguien que revise el trabajo puede ver qu\u00e9 configuraciones se utilizaron en lugar de buscar a trav\u00e9s de scripts largos.<\/p>\n<h2>hacer que el entorno computacional sea reproducible<\/h2>\n<p>El c\u00f3digo cient\u00edfico no se ejecuta de forma aislada. Depende de los lenguajes de programaci\u00f3n, bibliotecas, compiladores, sistemas operativos y, a veces, hardware. Un gui\u00f3n que funciona hoy puede fallar el pr\u00f3ximo a\u00f1o porque cambi\u00f3 una biblioteca.<\/p>\n<p>Para reducir este riesgo, documente el entorno computacional. Dependiendo del idioma y el proyecto, esto puede incluir <strong>requirements.txt<\/strong>, <strong>environment.yml<\/strong>, archivos de bloqueo, entornos virtuales, contenedores o versiones documentadas del compilador.<\/p>\n<p>El objetivo es evitar el problema de \"funciona en mi m\u00e1quina\". Un colaborador deber\u00eda poder configurar un entorno similar y ejecutar el c\u00f3digo sin adivinar qu\u00e9 versiones de paquetes se utilizaron.<\/p>\n<p>Para trabajos publicados importantes, considere archivar la versi\u00f3n exacta del c\u00f3digo y la informaci\u00f3n del entorno utilizada para producir los resultados.<\/p>\n<h2>Pruebe la l\u00f3gica cient\u00edfica cr\u00edtica<\/h2>\n<p>Las pruebas no son s\u00f3lo para software comercial. El c\u00f3digo cient\u00edfico puede ejecutarse sin errores y a\u00fan as\u00ed producir resultados err\u00f3neos. Las pruebas ayudan a detectar errores antes de que afecten las conclusiones.<\/p>\n<p>No todas las partes de un proyecto de investigaci\u00f3n necesitan pruebas exhaustivas, pero se debe verificar la l\u00f3gica cr\u00edtica. Esto incluye funciones de limpieza de datos, rutinas num\u00e9ricas, conversiones de unidades, condiciones de contorno, c\u00e1lculos estad\u00edsticos y salidas de simulaci\u00f3n.<\/p>\n<table class=\"custom-table\">\n<tbody><tr>\n<th>Tipo de prueba<\/th>\n<th>lo que protege<\/th>\n<th>Ejemplo<\/th>\n<\/tr>\n<tr>\n<td>Prueba de unidad<\/td>\n<td>Comportamiento de funci\u00f3n peque\u00f1a<\/td>\n<td>Una funci\u00f3n de normalizaci\u00f3n devuelve los valores esperados.<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td>Prueba de regresi\u00f3n<\/td>\n<td>Resultados verificados previamente<\/td>\n<td>Una simulaci\u00f3n todav\u00eda produce la misma salida de referencia.<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td>Prueba de validaci\u00f3n de datos<\/td>\n<td>Supuestos de entrada<\/td>\n<td>No aparecen valores negativos en un campo que debe ser positivo.<\/td>\n<\/tr>\n<tr>\n<td>Prueba de integraci\u00f3n<\/td>\n<td>Comportamiento completo del flujo de trabajo<\/td>\n<td>La canalizaci\u00f3n se ejecuta desde los datos de entrada hasta la salida final.<\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody><\/table>\n<p>Las pruebas son especialmente \u00fatiles cuando cambia el c\u00f3digo. Un peque\u00f1o refactor puede alterar accidentalmente los resultados. Una prueba de regresi\u00f3n puede advertirle cuando un cambio afecta a la salida en la que se confiaba previamente.<\/p>\n<h2>Tratar los datos como parte del flujo de trabajo de base de c\u00f3digo<\/h2>\n<p>El c\u00f3digo cient\u00edfico generalmente depende en gran medida de los datos. Si el flujo de trabajo de datos no est\u00e1 claro, los resultados son dif\u00edciles de reproducir incluso cuando el c\u00f3digo est\u00e1 disponible.<\/p>\n<p>Los datos sin procesar deben conservarse siempre que sea posible. No edite manualmente los archivos originales sin registrar lo que cambi\u00f3. Si los datos deben limpiarse o transformarse, documente los pasos y conserve el c\u00f3digo de procesamiento.<\/p>\n<p>Seguimiento de versiones de conjuntos de datos. Registre de d\u00f3nde provienen los datos, cu\u00e1ndo se descarg\u00f3 o se recopil\u00f3, qu\u00e9 exclusiones se aplicaron, c\u00f3mo se manejaron los valores faltantes y qu\u00e9 archivo procesado se utiliz\u00f3 para cada resultado.<\/p>\n<p>Para archivos importantes, las sumas de verificaci\u00f3n o los manifiestos pueden ayudar a confirmar que los datos no han cambiado de forma inesperada. Esto es especialmente \u00fatil cuando se trabaja con grandes conjuntos de datos, almacenamiento compartido o proyectos de larga duraci\u00f3n.<\/p>\n<h2>Evite las canalizaciones de investigaci\u00f3n solo para port\u00e1tiles<\/h2>\n<p>Los cuadernos son \u00fatiles para la exploraci\u00f3n, visualizaci\u00f3n y explicaci\u00f3n. Permiten a los investigadores combinar c\u00f3digo, texto, tramas y resultados en un solo lugar. Pero los cuadernos pueden ser dif\u00edciles de mantener cuando realizan toda la tuber\u00eda de investigaci\u00f3n.<\/p>\n<p>Los problemas comunes de cuaderno incluyen celdas que se quedan sin orden, estado oculto, dependencias poco claras, c\u00f3digo repetido, an\u00e1lisis mixto y l\u00f3gica de producci\u00f3n, y funciones de prueba de dificultad.<\/p>\n<p>Un mejor enfoque es utilizar cuadernos para la exploraci\u00f3n y la comunicaci\u00f3n, mientras se mueven funciones estables a archivos fuente reutilizables. Los cuadernos deben llamar c\u00f3digo probado en lugar de contener toda la l\u00f3gica importante.<\/p>\n<p>Antes de compartir o archivar un cuaderno, rein\u00edcielo y ejecute todas las celdas de arriba a abajo. Esto ayuda a confirmar que el cuaderno no depende del estado oculto de experimentos anteriores.<\/p>\n<h2>Use revisiones de c\u00f3digo o verificaciones de pares cuando sea posible<\/h2>\n<p>El c\u00f3digo cient\u00edfico se beneficia de la revisi\u00f3n. Una segunda persona puede notar suposiciones poco claras, unidades incorrectas, caminos fr\u00e1giles, falta de validaci\u00f3n, nombres confusos o l\u00f3gica duplicada que el autor puede pasar por alto.<\/p>\n<p>La revisi\u00f3n del c\u00f3digo en la investigaci\u00f3n no necesita ser formal o intimidante. Incluso una breve verificaci\u00f3n de pares puede mejorar la confiabilidad. Un colaborador puede revisar una funci\u00f3n de limpieza de datos, una implementaci\u00f3n de modelo, un c\u00e1lculo estad\u00edstico o el script que genera cifras finales.<\/p>\n<p>El objetivo no es la cr\u00edtica. El objetivo es proteger la investigaci\u00f3n de errores evitables. El trabajo cient\u00edfico se vuelve m\u00e1s fuerte cuando el c\u00f3digo importante es m\u00e1s f\u00e1cil de inspeccionar para otra persona.<\/p>\n<h2>Registre los experimentos y los resultados con claridad<\/h2>\n<p>Los proyectos cient\u00edficos a menudo involucran muchas ejecuciones con diferentes par\u00e1metros, conjuntos de datos, semillas aleatorias o configuraciones de modelos. Sin un registro claro, se vuelve dif\u00edcil saber qu\u00e9 ejecuci\u00f3n produjo qu\u00e9 resultado.<\/p>\n<p>Los registros de experimentos \u00fatiles pueden incluir:<\/p>\n<ul>\n<li>Fecha y hora<\/li>\n<li>Versi\u00f3n de c\u00f3digo<\/li>\n<li>Versi\u00f3n del conjunto de datos<\/li>\n<li>par\u00e1metros<\/li>\n<li>semilla al azar<\/li>\n<li>Entorno de software<\/li>\n<li>Lugar de salida<\/li>\n<li>Estado de \u00e9xito o fracaso<\/li>\n<li>Notas cortas sobre cambios<\/li>\n<\/ul>\n<p>Las semillas aleatorias son especialmente importantes en simulaciones, aprendizaje autom\u00e1tico, muestreo y modelos estoc\u00e1sticos. Registrarlos ayuda a que los resultados sean m\u00e1s f\u00e1ciles de reproducir y depurar.<\/p>\n<h2>Manejar errores y casos de borde expl\u00edcitamente<\/h2>\n<p>En la inform\u00e1tica cient\u00edfica, las fallas silenciosas pueden ser peores que los errores visibles. Un script que se bloquea claramente es m\u00e1s f\u00e1cil de arreglar que un script que produce resultados incorrectos en silencio.<\/p>\n<p>Valide las entradas antes de ejecutar los c\u00e1lculos principales. Verifique las unidades, rangos, dimensiones, valores faltantes, existencia de archivos y suposiciones sobre los datos. Si una suposici\u00f3n cr\u00edtica falla, la tuber\u00eda deber\u00eda detenerse o advertir claramente.<\/p>\n<p>Los mensajes de error deben ser significativos. Un mensaje como <strong>Falta el archivo de entrada: Data\/Procesed\/Clean_Sample.csv<\/strong> esperado es mucho m\u00e1s \u00fatil que un bloqueo gen\u00e9rico.<\/p>\n<p>Un buen manejo de errores protege la integridad de la investigaci\u00f3n porque evita que las suposiciones incorrectas se desplacen silenciosamente hacia los resultados finales.<\/p>\n<h2>Plan de entrega y uso a largo plazo<\/h2>\n<p>El c\u00f3digo cient\u00edfico a menudo sobrevive a la persona que lo escribi\u00f3. un estudiante se grad\u00faa. Un postdoctorado se va. Un colaborador se une m\u00e1s tarde. Un laboratorio quiere reutilizar una canalizaci\u00f3n para un nuevo proyecto. La planificaci\u00f3n para el traspaso hace que esta transici\u00f3n sea m\u00e1s f\u00e1cil.<\/p>\n<p>Un proyecto mantenible debe incluir una gu\u00eda de configuraci\u00f3n, entrada y salida de ejemplo, limitaciones conocidas, descripci\u00f3n del flujo de trabajo, seguimiento de problemas, licencia, informaci\u00f3n de citas y versi\u00f3n archivada para el trabajo publicado.<\/p>\n<p>Tambi\u00e9n es \u00fatil incluir una breve explicaci\u00f3n de lo que el c\u00f3digo no hace. Las limitaciones forman parte de la documentaci\u00f3n responsable. Ayudan a los futuros usuarios a evitar aplicar el c\u00f3digo de manera que no fue dise\u00f1ado.<\/p>\n<h2>Errores comunes a evitar<\/h2>\n<h3>Mantener todo en un gui\u00f3n<\/h3>\n<p>Un script grande puede ser r\u00e1pido de escribir, pero se vuelve dif\u00edcil de leer, probar, depurar y reutilizar. Divida la l\u00f3gica estable en funciones y m\u00f3dulos.<\/p>\n<h3>Cambiar datos manualmente sin grabarlos<\/h3>\n<p>Las ediciones manuales dificultan la reproducibilidad. Si los datos cambian, el cambio debe documentarse o realizarse a trav\u00e9s de un script.<\/p>\n<h3>Dependiendo de las versiones de software no especificadas<\/h3>\n<p>Si no se registran las dependencias, otro usuario puede instalar versiones m\u00e1s recientes y obtener resultados o errores diferentes.<\/p>\n<h3>Tratar las pruebas como innecesarias<\/h3>\n<p>El c\u00f3digo cient\u00edfico puede contener errores graves incluso cuando se ejecuta con \u00e9xito. Las pruebas protegen los c\u00e1lculos y los flujos de trabajo cr\u00edticos.<\/p>\n<h3>Documentando solo al final<\/h3>\n<p>Los detalles importantes a menudo se olvidan al final de un proyecto. Documente las suposiciones, los par\u00e1metros y las decisiones del flujo de trabajo a medida que se desarrolla el proyecto.<\/p>\n<h2>Pensamientos finales: el c\u00f3digo mantenible hace que la ciencia sea m\u00e1s f\u00e1cil de confiar<\/h2>\n<p>Mantener el c\u00f3digo cient\u00edfico no se trata de hacer que la investigaci\u00f3n sea m\u00e1s lenta. Se trata de hacer que la investigaci\u00f3n sea m\u00e1s f\u00e1cil de entender, repetir, verificar y extender. Un proyecto con estructura clara, control de versiones, documentaci\u00f3n, pruebas, entornos reproducibles y un cuidadoso manejo de datos es m\u00e1s confiable que uno mantenido unido por la memoria y los archivos dispersos.<\/p>\n<p>Las buenas pr\u00e1cticas de mantenimiento no necesitan ser excesivas. Comience con lo b\u00e1sico: nombres claros, carpetas organizadas, un archivo L\u00e9ame, control de versiones, dependencias registradas, pruebas simples y pasos de datos documentados. Estos h\u00e1bitos crean una base que protege tanto el software como la investigaci\u00f3n construida sobre \u00e9l.<\/p>\n<p>El c\u00f3digo cient\u00edfico es parte de la evidencia detr\u00e1s de las afirmaciones cient\u00edficas. Cuando se mantiene bien, los resultados se vuelven m\u00e1s f\u00e1ciles de confiar y el trabajo futuro se vuelve m\u00e1s f\u00e1cil de construir.<\/p>\n"},"excerpt":{"rendered":"<p><span class=\"span-reading-time rt-reading-time\" style=\"display: block;\"><span class=\"rt-label rt-prefix\">Reading Time: <\/span> <span class=\"rt-time\"> 9<\/span> <span class=\"rt-label rt-postfix\">minutes<\/span><\/span>El c\u00f3digo cient\u00edfico a menudo comienza como un gui\u00f3n r\u00e1pido. Un investigador necesita limpiar un conjunto de datos, ejecutar una simulaci\u00f3n, probar un modelo, generar una figura o verificar una hip\u00f3tesis. Al principio, el c\u00f3digo puede ser escrito para una persona y una tarea inmediata. 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